Coronavirus (SARS-CoV-2) nyhetstråd

[BirgitS]

Det kommunala självstyret (till vilket regionerna räknas) är grundlagsfäst så statens inflytande är begränsat i det sammanhanget. Det krävs lagstiftning för att få kommuner och regioner att "rätta in sig i ledet".

Det må så vara men ändå har regioner ändrat sig när Fohm har sagt att de bör följa rekommendationerna.

 

[BirgitS]

Kan nån förklara detta för mig - varför har Finland och Norge bara EN prick (om än stor), medan Sverige har en massa? Skulle man lägga ihop Sveriges till en enda så skulle det bli en mycket större prick än grannländernas.
(Och kom inte med att det är de olika geografiska platserna som visas, jag tror inte en sekund på att den största norska smittspridningen är uppe på Hardangervidda…)
[bild]
Även Frankrike, Polen, Turkiet m.fl. verkar bara få en prick.

Kanske att de bara har tillgång till nationella data för en del länder medan de för andra länder har tillgång till regionala data?
Det verkar stämma rätt bra att det är en prick för varje region i Sverige i alla fall.

 

[b8q]

Kanske att de bara har tillgång till nationella data för en del länder medan de för andra länder har tillgång till regionala data?
Det verkar stämma rätt bra att det är en prick för varje region i Sverige i alla fall.

Jo, det är säkert regionala kontra nationella datapunkter, men jag tycker ändå att summan av Sveriges regionala prickar ser ut att vara mer än Norges och Finlands nationella, vilket ju inte är sant. Kan möjligen stämma ifall storleken är exponentiell, men det framgår isåfall verkligen inte av kartan. Riktigt dålig infografik.

LITE tydligare blir det om man går direkt till Johns Hopkins, då man kan tända teckenförklaringen, men det är ändå lite dåligt att en till ytan 10 gånger så stor prick motsvarar 100 gånger så höga siffror. I det här fallet borde man absolut ha jobbat med endast nationella siffror över hela kartan.

Inloggade ser högupplösta bilder

Logga in

Skapa konto

Gratis och tar endast 30 sekunder

 

[BirgitS]

Nu har ett fall av misstänkt omicronvariant upptäckts i Tyskland.
https://www.svt.se/nyheter/inrikes/senaste-nytt-om-coronaviruset kl. 11.47.

 

[Ulltand]

Background

• Regarded as the most heavily mutated variant of the Coronavirus, thus far, as it has 32 mutations in the spike protein and 50 overall. More specifically, scientists have highlighted that there are 10 mutations vs 2 in the Delta variant regarding the receptor binding domain, which is the portion of the virus that makes initial contact with cells.
• The Omicron variant was identified 5 days ago initially in Botswana with subsequent confirmation and sequencing in South Africa with about 100 confirmed cases. Cases have been detected in Israel and Hong Kong and as of this morning, in Belgium.
• Sequencing data suggests 8.1.1.529 has a different evolutionary pathway, but shares a few common mutations with the C.1.2, Beta and Delta variants.

Is it more deadly

• It is currently too early to determine if the new variant has higher mortality than previous variants. Reported cases only started rising in South Africa on 19 November, so any impact on hospitalizations and COVID-related deaths will not have yet emerged.

Testing and Detectability

• Tulio de Oliveria, the Director of the Centre for Epidemic Response & innovation (CERI), South Africa, has written that the variant can be detected by a normal PCR test and as such it will be "easy for the world to track it". It wasn't immediately clear if this is one of those "excess false positive PCR tests" but it's safe to assume for now that it is.
  
  
• According to Credit Suisse, "one silver lining may come in the ease of identifying this variant via qPCR tests. B.1.1.529 has a deletion within the s-gene which can be identified easily via widely-used PCR tests. More complex sequencing analysis is needed to differentiate the delta variant. This will help track the spread of B.1.1.529, both within Southern Africa and across the globe."

How widespread is it

• As of Thursday there were almost 100 cases detected in South Africa, where it’s become the dominant strain among new infections. Early PCR test results showed that 90% of 1,100 new cases reported Wednesday in the South African province that includes Johannesburg were caused by the new variant, according to de Oliveira.
• In neighboring Botswana, officials recorded four cases on Monday in people who were fully vaccinated. In Hong Kong, a traveler from South Africa was found to have the variant, and another case was identified in a person quarantined in a hotel room across the hall. Israel has also identified one case in a man who recently traveled to Malawi. Belgium has also reported two new cases.
• According to de Oliveira, this new variant, B.1.1.529 "seems to spread very quick! In less than 2 weeks now dominates all infections following a devastating Delta wave in South Africa (Blue new variant, now at 75% of last genomes and soon to reach 100%)"

Transmission

• Oliveria, explains that the new variant is spreading very quickly, in under two-weeks it is now dominating all infections in South Africa following the Delta waves domination – writing that it the variant is “now at 75% of last genomes and soon to reach 100%”.
  
  
• Additionally, the virus contains mutations that have been seen in other variants and appear to make transmission easier.
  
  
• Outside of Africa, two cases have been reported in Hong Kong, one from a traveller from the region and another who was quarantining in the adjacent hotel room. Most recently, a case has been reported in Israel.
  
  
• In response to this, the UK has placed much of southern Africa on the red list, with Israel India, Japan and Singapore also taking similar measures. Additionally, EU Commission President von der Leyen is to propose activation of the emergency air brake, to halt travel from southern Africa.

Vaccines

• It is too early to accurately determine the vaccine response to the new variant. However, the significant number of variants increase the likelihood that current vaccines, which were designed with the original COVID-19 strain in mind, may be less effective.
  
  
• Known variants include those that make it more challenging for antibodies to recognise their presence.
  
  
• Laboratory testing is already underway according to the South Africa National Institute for Communicable Diseases Initial thoughts from the institute are that partial immune escape is likely, a view that seems possible given the numerous mutations in comparison to the sequence that existing vaccines were designed against. The first view on this to be from in vitro immunogenicity test or perhaps from computer modelling of the sequence. Credit Suisse estimates initial lab data could take less than 1 week to generate given the sequence is already known and work is already ongoing.

New Vaccine Would be Available in 100 days

• According to Pfizer, if a vaccine-escape variant emerges, the company expects to develop, produce a tailor-made vaccine against that variant in 100 days.

Impact of efficacy of existing drugs antibodies is unknown.

• There have been significant advances in treatment of COVID since it emerged in the disease waves of 2020: the use of widely-available steroids, and anti-inflammatory drugs, such as Roche's Actemra have significantly improved survival outcomes.
  
  
• More recently, antibody therapies targeting COVID (LLY, REGN/Roche, AZN) have significantly improved outcomes against COVID variants to date. It will need to be seen if their efficacy is equal against the new B1.1.529 variant.
  
  
• Lastly the recent positive data from oral anti-viral agents (PFE, MRK/Ridgeback) may also have the potential to slow the spread of any new waves of COVID. The effectiveness of these treatments against new variants of concern will need to be tested, but lab results should be expected relatively quickly. In-human studies should also yield results relatively quickly if they are run in areas where the prevalence of 8.1.1.529 is high.

What's next

• According to Citi, concern over Omicron needs to be balanced against the failure of other concerning variants such as Beta (also first identified in Africa) to out-compete delta.
  
  
• The next two weeks will be critical to: (i) determine whether Omicron outcompetes delta in high delta prevalence countries (2-3 weeks), (ii) engineered pseudoviruses for Omicron to determine neutralization by serum of vaccination and previously infected patients (2-4 weeks), and (iii) real world data to determine rates of hospitalisation and death (c. 6-8 weeks). The implementation of travel restrictions and public health measures may push back some of the above timeline estimates. Novel oral anti-virals should retain activity against Omicron but resistance may emerge with time.

Bra sammanställning. Ser riktigt illa ut med smittsamheten. OM dödligheten skulle vara större och vaccinet inte fungerar så bra är det katastrof. Tänker att B-cells skyddet iaf inte borde vara noll efter vaccin eller sjukdom.

Läge att göra som Nya Zeeland nu. Stäng gränsen (hård karantän) i några veckor för att se vart det tar vägen.

Nya riktade vacciner går realtivt snabbt att ta fram dess bättre.

 

[Ulltand]

En studie i Bangladesh är sanning för den stödjer din tes om munskydd. När någon studerar rådata och finner att skillnaden är på 20 individer i en grupp på 340,000 så är dels den som kritiserar (en känd professor) nedgraderad till en okänd 'bloggare" och även om det skulle stämma så är 20 stycken tillräckligt som bevis...

Du måste vara lite källkritisk. 20 personer är grundargumentet i bloggen.

Men stämmer det? Var står det i så fall?

Det står i studien att det är betydligt fler.

En studien har ett visst vetenskapligt värde, en blogg ett annat som ställer betydligt högre krav på kritiskt läsande.

 

[Ulltand]

Anders Tegnell anser att det för tidigt att vara orolig nu men för sent när vi har facit om två veckor.

""– Det är för tidigt att göra någon bedömning kring hur oroliga vi behöver vara över den här varianten. Sedan är det så att när det väl har börjat röra sig mellan länder går det nog inte att få stopp på den, sa Tegnell till Expressen.""

 

[BirgitS]

Anders Tegnell anser att det för tidigt att vara orolig nu men för sent när vi har facit om två veckor.

""– Det är för tidigt att göra någon bedömning kring hur oroliga vi behöver vara över den här varianten. Sedan är det så att när det väl har börjat röra sig mellan länder går det nog inte att få stopp på den, sa Tegnell till Expressen.""

Är det någonsin någon nytta med att känna sig just orolig?
Det är ju något helt annat än att göra något åt saken, vilket ju Fohm gjorde igår.

 

[Ulltand]

Är det någonsin någon nytta med att känna sig just orolig?
Det är ju något helt annat än att göra något åt saken, vilket ju Fohm gjorde igår.

Du menar att man rekommenderas att testa sig om varit i vissa länder?

Det är ju mer ett skämt i så fall. Tvingande karantän och obligatorisk testning efter det kunde ge någon chans att lyckas.

 

[BirgitS]

Du menar att man rekommenderas att testa sig om varit i vissa länder?

Det är ju mer ett skämt i så fall. Tvingande karantän och obligatorisk testning efter det kunde ge någon chans att lyckas.

Nu har vi ju vissa grundlagar i Sverige som myndigheter måste följa så du föreslår ju bara sånt som är en omöjlighet.

Sen finns det ju inget land där det har fungerat med tvingande karantän för att förhindra all smittspridning. På karantänhotellen vid Gardemoen avvek personerna under tiden de skulle vara där och polisen kunde inte göra något. I Australien har det funnits utbrott som har utgått från dessa karantänhotell. Du verkar leva i en helt annan värld än alla andra.

 

[Fairlane]

Du måste vara lite källkritisk. 20 personer är grundargumentet i bloggen.

Men stämmer det? Var står det i så fall?

Det står i studien att det är betydligt fler.

En studien har ett visst vetenskapligt värde, en blogg ett annat som ställer betydligt högre krav på kritiskt läsande.

Ja källkritisk är visst vad jag försöker vara, medan du verkar skippa den delen om det är ett resultat du inte gillar, eller för all del även om du gillar resultatet, men det är svagt.

Siffrorna finns kanske i rådata som är länkat till tre gånger redan. Finns det där så kan du kolla själv eller så kommer fler göra det.

Visst kan du raljera över att det är en blogg, men det är en blogg från en känd professor där han påstår sig gått igenom siffrorna. Rimligen hittat han inte på hej vilt bara för det är en blogg. Hans akademiska heder står på spel isåfall. Man kan inte jämföra honom med en random bloggare eller en random skribent på byggahus.

 

[Fairlane]

Läge att göra som Nya Zeeland nu. Stäng gränsen (hård karantän) i några veckor för att se vart det tar vägen.

Och hur gör vi om några veckor? Behåller gränsen stängd ett år eller två om det ser ut som det sprids?

 

[BirgitS]

TT har gjort en bra sammanställning av vad man vet just nu om omikron: https://www.gp.se/nyheter/sverige/detta-vet-vi-om-nya-mutationen-1.60219100

Den nya mutationen upptäcktes först i Sydafrika och Botswana. Ytterligare fall har konstaterats i Hongkong och Israel. I Europa har fall konstaterats i åtminstone Belgien och Storbritannien. Även Tyskland har misstänkta fall.

Från andra håll rapporteras det även om Nederländerna.

På den så kallade ACE2-receptorn, den del av spikproteinet som först kommer i kontakt med cellen, har den nya varianten tio mutationer, rapporterar BBC. Beta- och deltavarianterna har, som jämförelse, tre respektive två.

Vissa av mutationerna i omikron har upptäckts i tidigare varianter och har kopplats till en ökad förmåga för viruset att smitta och ta sig förbi immunförsvar.

EU:s smittskyddsmyndighet ECDC säger att det finns "mycket hög risk" för att varianten kommer att spridas i Europa.

Biontech (Pfizers vaccin) har börjat studera hur varianten reagerar på deras vaccin och tror att de kan säga något inom två veckor.

Johnson & Johnson och Moderna har bägge meddelat att deras vaccin kan fungera sämre mot omikron, men att de arbetar med att ta fram uppdaterade versioner – något som de säger kan ta 100 dagar.

 

[BirgitS]

Den nya mutationen upptäcktes först i Sydafrika och Botswana. Ytterligare fall har konstaterats i Hongkong och Israel. I Europa har fall konstaterats i åtminstone Belgien och Storbritannien. Även Tyskland har misstänkta fall.
Från andra håll rapporteras det även om Nederländerna.

Nu även en patient på ett sjukhus i Italien. Hen hade rest från Mozambique.

Troligen minst tre fall i Tyskland.
https://www.svt.se/nyheter/inrikes/senaste-nytt-om-coronaviruset kl. 19.55 som fått det från Reuters

 

[pmd]

FDA vill ha 10 personer att processa och ge ut 500 sidor/mån. Med antalet sidor så resulterar det i att allt blir klart 2076

Vi får kanske utgå från att de har räknat rätt?