Jättesvårt att svara på utan att veta era förutsättningar men jag gör en liten spec ändå, det är inte säkert att den stämmer in på er.
Vattenburet är bra om:
Ni tänker bo länge i huset.
Ni har en bra värmekälla eller tänker byta ut er gammla el/oljepanna mot effektivare prylar innom överskådlig framtid.
Om det är ok med den högre bygghöjden.
Elgolvvärme:
Billigare att installera.
lägre bygghöjd.
Dyrare i drift.
Dvs om ni tänker bo i huset länge och har bra värmesystem så skulle jag satsat på vattenburet om bygghöjden funkar.